Problemas con apps que se instalan solas y mandan publicidad

Hola a todos. Soy nuevo en el foro, pero espero que me puedan ayudar xq ya no se que hacer. El tema es que quise rootear mi telefono con iRoot y Kinguser para lograr que las descargas de aplicaciones y otros se hagan directamente a la tarjeta SD. El tema es que luego de hacer esto me empezaron a saltar ventanas emergentes con publicidad cuando estoy en whatsapp o en facebook. Son muy molestas e incluso a veces se me pone la pantalla en negro. Tambien se abre como una aplicación q se llama settings y luego aparecen mensajes como "settings se ha cerrado". Reinicie mi telefono en modo seguro y en aplicaciones descargadas aparecen "android system", "UC News" y un "Whatsapp" que no es el original. Ya lo restablecí como de fabrica y sigue pasando. Se instalan solas y no se como hacer para evitarlo y poder usar mi telefono tranquilo. Les pido por favor si me pueden ayudar. Desde ya muchas gracias.

Es un Sony Xperia ZR.