Batería en teléfono rooteado

Buen dia.
Tengo dos teléfonos Samsung, uno es un J2 prime y el otro es un Jpro, muy similares, usan la misma batería y la situación es la siguiente:
El j2 prime lo tengo rooteado y su batería no es la que venía con el teléfono, la compré en otro establecimiento.
El Jpro tiene todo original.
El caso es que intercambié baterías y puse a cargar la batería del teléfono rooteado en el jpro durante toda la noche y llamó poderosamente mi atención que la carga no pasaba del 67% en la pantalla.
Lo desconecté y coloqué la batería en el teléfono que corresponde y al encenderlo la lectura de la batería era del 94%, lo apagué, lo conecté a la corriente y en cosa de pocos minutos llegó la carga al 100%.
¿Por qué sucede esto?, ¿influye en la lectura de carga el tener rooteado el celular?, la pila en cuestión la compré hace un par de semanas.
Agradezco todo lo que me puedan aportar para comprender y corregir el problrma.